Pentacarinat enthält den Wirkstoff Pentamidinisethionat. Pentacarinat ist gegen den Parasiten Pneumocystis jirovecii wirksam; einen Erreger, der vor allem bei Patienten mit stark reduzierter Infektabwehr Lungenentzündungen hervorrufen kann. Pentacarinat darf nur auf Verschreibung des Arztes oder der Ärztin angewendet werden.  Pentacarinat wird als Inhalationsbehandlung angewendet, um Rückfällen einer durch Pneumocystis jirovecii hervorgerufenen Lungenentzündung vorzubeugen, wenn eine Gegenanzeige gegen Sulfamethoxazol-Trimethoprim (Cotrimoxazol) vorliegt. Durch die Inhalation gelangt das Arzneimittel direkt in die Lunge, sodass eine hohe Wirkstoffkonzentration genau da erreicht wird, wo sich der Krankheitserreger befindet.

Auch parenteral (als Spritze/Infusion) kann Pentacarinat zur Behandlung der Pneumocystis-jirovecii-Pneumonie angewendet werden, wenn eine Gegenanzeige gegen Cotrimoxazol vorliegt.